В Севастополе расположено множество музеев, посвящённых истории, военной истории, археологии, искусству и другим темам.
Государственный историко-археологический музей-заповедник «Херсонес Таврический»
Расположен на месте древнего города Херсонеса. Включает историко-археологическую территорию под открытым небом с остатками сооружений древнего Херсонеса и артефактами, найденными на его территории. Здесь можно узнать о развитии города в разные периоды его существования, особенностях градостроительства, архитектуры и жизни людей в Херсонесе. На территории проложены деревянные дорожки, возле каждого объекта есть информационная табличка с описанием.
Балаклавский подземный музейный комплекс
Расположен на территории бывшей советской военно-морской базы, которая частично находится в скалах и под землёй. Здесь можно увидеть реальные советские подводные лодки, торпеды, ракеты и другое военно-морское оборудование. В музее есть интерактивные площадки и мультимедийные зоны со световыми и шумовыми спецэффектами.
Музейный историко-мемориальный комплекс 35-й батареи
Посвящён защитникам Севастополя. Расположен на территории бывшей береговой батареи. Здесь можно прогуляться по казематам и коридорам, подняться на смотровую площадку с видом на город. В музее есть Пантеон Славы с именами погибших защитников Севастополя, а также залы с военной историей, где представлены форма офицеров, документы кампаний и личные письма.
Военно-исторический музей Черноморского флота
Филиал Центрального военно-морского музея имени императора Петра Великого. Ведёт историю от Музея Севастопольской обороны 1854–1855 годов. В музее представлены экспонаты, отражающие события на Черноморском флоте с 1783 по 1945 год, включая личные вещи руководителей обороны и картины известных художников.
Музей «Подземный Севастополь»
Расположен в бывшем противоатомном бункере «Объект С-2», построенном в 1953–1956 годах.
Музейный комплекс «Михайловская батарея»
Военно-исторический музей фортификационных сооружений.
Музей героической обороны и освобождения Севастополя
Крупнейший музейный комплекс города и Крыма. В его состав входят:
- здание с панорамой «Оборона Севастополя 1854–1855 гг.»;
- диорама на Сапун-горе, посвящённая штурму 7 мая 1944 года;
- Владимирский собор в византийском стиле;
- Малахов курган с оборонительной башней;
- дом, где во времена фашистской оккупации действовали представители севастопольского подполья.