Экспозиция знакомит посетителей с растительным и животным миром Анапы, а также с обитателями глубин Черного моря.
Раздел «Природа Анапы» состоит из восьми комплексов: «Палеонтология»; «Горные породы и минералы России»; «Лечебно-оздоровительные факторы курорта Анапа»; «Насекомые Анапского региона»; «Гербарий»; «Анапские плавни»; «Лесостепь»; «Лес». В экспозиции распложены шесть минидиорам с образцами растений и таксидермическими скульптурами, в числе которых рыжая лиса, кролик степной, хищные птицы (курганник, степной подорлик), фазаны, щегол, горихвостка, черный дрозд, дрозд-рябинник, иволга. Ее дополняют объемная карта Таманского полуострова и геохронологическая таблица.
Раздел «Черное море» знакомит посетителей с морскими птицами (баклан, серощекая поганка, черноголовый хохотун, гагара, лебедь-шипун, серебристая чайка), обитателями морского каменистого дна (горбыль, морской ерш, рыба-игла, морской конек, полосатый окунь, сарган, каменный краб и др., а также морские моллюски – мидии, устрицы, рапан), обитателями морского песчаного дна (акула-катран, черноморская камбала-калкан, европейский угорь, скат-хвостокол, скат ромбовидный, пеламида, ставрида, звездочет, морской петух, барабуля и др).