В депозитарии организовано открытое, то есть доступное для посетителей хранение предметов, что позволяет увидеть многочисленные музейные коллекции. В большом зале первого этажа представлены устюжские изразцы и зеркала изразцовых печей, собранные из подлинных предметов XVIII–XIX вв. В застекленных нишах воссозданы интерьеры жилых комнат XIX в. Дополняют представление о вкусах и предпочтениях устюжан стулья, диваны, буфеты, трюмо. На специально созданной для показа «горке» экспонируется коллекция прялок.
На галерее второго этажа центральное место отведено уникальному устюжскому промыслу – шемогодской резной бересте. Здесь и работы мастеров первой половины XX в. с традиционным орнаментом, и продукция артелей советского периода. Две отдельные витрины занимают изделия непревзойденного мастера резьбы по бересте А. Е. Марковой.
Вниманию посетителей также представлены высокохудожественные памятники культового назначения XVI – начала XX в. из серебряной кладовой музея, в том числе предметы, декорированные эмалью, чернью, позолотой, драгоценными и полудрагоценными камнями.
Экспонируются и костяные изделия различных центров резьбы по кости, фарфоровые изделия российских и иностранных заводов.
В отдельном зале второго этажа демонстрируется коллекция предметов из металла. В основном это самовары. Самый ранний из них датируется первой половиной XVIII в. Здесь же представлены поддужные колокольчики, подсвечники, канделябры, замки и ключи.