Научная библиотека находится в отреставрированном здании Главного (Больничного) корпуса Тобольского тюремного замка, архитектурного памятника середины XIX века. Ее уникальный интерьер воссоздан по фотографиям и представляет собой реконструкцию внутреннего вида Губернской библиотеки конца XIX – начала XX в. и экспозицию «Кабинет А. С. Суханова». Посетители знакомятся с тематическими выставками, историей формирования фондов, деятельностью первых библиотекарей. В витринах читального зала размещаются издания и музейные предметы по актуальной тематике сменно-выставочных проектов.
Главная гордость – уникальный фонд, который насчитывает 55 000 единиц хранения, где свыше 35 тысяч (издания XVII – первой половины XX вв.,) относятся к категории уникальных и редких. Фонд размещен в трех книгохранилищах с современным оборудованием.
Ученые-историки, этнографы, археологи находят здесь богатейший материал для своих исследований, посвященных Сибири. Условия работы в научной библиотеке отличаются комфортом для посетителей и сотрудников.