В фондах музея собрано около 15 тыс. экспонатов, при этом выставочные площади он имеет совсем небольшие. Тем не менее в его залах представлены почти все темы научных и исторических исследований, которыми занимаются сотрудники. Музей активно развивается.
Сейчас вниманию посетителей предлагаются постоянные экспозиции «Интерьер писательской комнаты», «Малаховка театральная», «Комната дачного дома», «Деревенская комната», «Марк Шагал в Малаховке», «Война. Победа. Память» и другие.
Экспонаты раскрывают историю Малаховки, где жили и гостили летом видные деятели культуры, искусства и науки. Многие богатые люди строили здесь свои красивейшие дачи. После революции дачный характер поселения сохранился, но изменились владельцы: отдельные дачи хорошо подошли для беспризорных детей, которых в то время в России появилось очень много. В Малаховке открылись детские дома под общим названием «Малаховский детский городок». В его составе была и еврейская детская колония «Третий интернационал», которая сейчас известна благодаря тому, что с 1919 по 1922 год здесь преподавал Марк Шагал.