«Древности Белозерья» – это первая полноценная выставка по археологии Белозерского края в Вологодской области. Впервые на Вологодчине показаны материалы монастырской археологии. Всего представлено более четырех тысяч археологических предметов различных хронологических периодов: от мезолита (IX тысячелетие до н. э.) и до позднего Средневековья.
Наиболее полно показан период Средневековья. Среди экспонатов есть уникальные произведения древнего искусства, единственные не только в собрании музея, но и в археологических коллекциях других музеев России.