В экспозиции представлены элементы материальной культуры древнейших племен и народов, проживавших на территории современной КЧР с эпохи каменного века до позднего Средневековья. Все экспонаты подлинные, они были собраны археологами в результате археологических раскопок, научных экспедиций по всем уголкам Карачаево-Черкесии в XX – начале XXI века. Есть также предметы, собранные краеведами, учителями школ с юными любителями истории, есть и случайные находки, обнаруженные во время проведения земляных работ или на полях, огородах, на берегах рек.
Все предметы бережно хранятся в фондохранилищах музея-заповедника. В витринах по комплексам в хронологическом порядке размещены предметы, возраст которых исчисляется столетиями, тысячелетиями, а некоторые – десятками и даже сотнями тысячелетий, как, например, каменные орудия из пещеры «Треугольной», найденные советскими археологами в 1986 году на горе Баранаха в Урупском районе КЧР. Эти каменные орудия были изготовлены около 500 тыс. лет назад, это самая древняя стоянка эпохи палеолита на Северном Кавказе.
Также выставлены красивые бронзовые изделия в виде блях, медальонов, пряжек, зеркал, пуговиц, пронизей, подвесок, фибул, серег, браслетов, на некоторых с орнаментами тончайшей работы. Эпоха раннего железа представлена предметами из позднекобанских, скифо-сармато-меотских поселений и погребений в виде наконечников копий и стрел, акинаков, конской упряжи, кувшинов, украшений.