Приобретая билет, можно посетить основные разделы постоянной экспозиции, рассказывающие об истории Алтайского края, его природных богатствах. В уютных залах «Дома купца Зубова» расположены разделы, посвященные древнейшей истории Алтая, миру природы, горнозаводскому производству, истории купечества, заселению территории русскими.
Каждый из разделов представлен подлинными музейными раритетами – образцами минералов и горных пород, археологическими артефактами эпохи палеолита, бронзового и железного веков, макетами инженерных изобретений XVIII–XIX вв., атрибутами купеческой жизни конца XIX – начала XX в.